Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms