Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trp53inp1Q9QXE4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms