Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms