Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdcQ9QW08 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms