Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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