Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Nkain4Q9JMG4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Nkain4Q9JMG4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkain4Q9JMG4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Nkain4Q9JMG4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkain4Q9JMG4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkain4Q9JMG4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkain4Q9JMG4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkain4Q9JMG4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkain4Q9JMG4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkain4Q9JMG4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkain4Q9JMG4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkain4Q9JMG4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms