Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms