Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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SrfQ9JM73 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SrfQ9JM73 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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