Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Rabgef1Q9JM13 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rabgef1Q9JM13 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rabgef1Q9JM13 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rabgef1Q9JM13 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rabgef1Q9JM13 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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