Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms