Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tgm1Q9JLF6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tgm1Q9JLF6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tgm1Q9JLF6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tgm1Q9JLF6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tgm1Q9JLF6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tgm1Q9JLF6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm1Q9JLF6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm1Q9JLF6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm1Q9JLF6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm1Q9JLF6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm1Q9JLF6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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