Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtsmQ9JL96 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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CtsmQ9JL96 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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CtsmQ9JL96 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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CtsmQ9JL96 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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CtsmQ9JL96 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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CtsmQ9JL96 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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CtsmQ9JL96 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms