Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot9Q9JKY0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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