Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms