Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmod2Q9JKK7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
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