Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Alyref2Q9JJW6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Alyref2Q9JJW6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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