Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra4Q9JJT2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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