Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efcc1Q9JJF6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms