Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc86Q9JJ89 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms