Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad9Q9JIW5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms