Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Sv2aQ9JIS5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Sv2aQ9JIS5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Sv2aQ9JIS5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Sv2aQ9JIS5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Sv2aQ9JIS5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Sv2aQ9JIS5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Sv2aQ9JIS5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Sv2aQ9JIS5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Sv2aQ9JIS5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sv2aQ9JIS5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sv2aQ9JIS5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sv2aQ9JIS5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sv2aQ9JIS5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sv2aQ9JIS5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sv2aQ9JIS5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sv2aQ9JIS5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sv2aQ9JIS5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sv2aQ9JIS5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sv2aQ9JIS5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sv2aQ9JIS5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sv2aQ9JIS5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sv2aQ9JIS5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sv2aQ9JIS5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sv2aQ9JIS5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sv2aQ9JIS5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sv2aQ9JIS5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sv2aQ9JIS5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sv2aQ9JIS5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sv2aQ9JIS5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sv2aQ9JIS5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sv2aQ9JIS5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms