Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ercc6l2Q9JIM3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ercc6l2Q9JIM3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc6l2Q9JIM3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc6l2Q9JIM3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc6l2Q9JIM3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc6l2Q9JIM3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc6l2Q9JIM3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc6l2Q9JIM3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc6l2Q9JIM3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc6l2Q9JIM3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc6l2Q9JIM3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc6l2Q9JIM3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc6l2Q9JIM3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc6l2Q9JIM3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc6l2Q9JIM3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc6l2Q9JIM3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc6l2Q9JIM3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc6l2Q9JIM3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc6l2Q9JIM3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc6l2Q9JIM3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc6l2Q9JIM3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc6l2Q9JIM3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms