Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tmod3Q9JHJ0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Tmod3Q9JHJ0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Tmod3Q9JHJ0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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Tmod3Q9JHJ0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Tmod3Q9JHJ0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Tmod3Q9JHJ0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Tmod3Q9JHJ0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Tmod3Q9JHJ0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Tmod3Q9JHJ0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Tmod3Q9JHJ0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Tmod3Q9JHJ0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Tmod3Q9JHJ0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Tmod3Q9JHJ0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Tmod3Q9JHJ0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Tmod3Q9JHJ0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod3Q9JHJ0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms