Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim39Q9ESN2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms