Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms