Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Usp29Q9ES63 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Usp29Q9ES63 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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Usp29Q9ES63 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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