Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Slc28a3Q9ERH8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Slc28a3Q9ERH8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a3Q9ERH8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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