Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfip11Q9ERA6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfip11Q9ERA6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfip11Q9ERA6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfip11Q9ERA6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfip11Q9ERA6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfip11Q9ERA6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfip11Q9ERA6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfip11Q9ERA6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfip11Q9ERA6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfip11Q9ERA6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfip11Q9ERA6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfip11Q9ERA6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfip11Q9ERA6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfip11Q9ERA6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfip11Q9ERA6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfip11Q9ERA6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfip11Q9ERA6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfip11Q9ERA6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfip11Q9ERA6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfip11Q9ERA6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfip11Q9ERA6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tfip11Q9ERA6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tfip11Q9ERA6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tfip11Q9ERA6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfip11Q9ERA6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms