Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms