Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufs3Q9DCT2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufs3Q9DCT2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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