Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCQ7

Serpina1f, Alpha-1-antitrypsin 1-6, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1fQ9DCQ7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Serpina1fQ9DCQ7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Serpina1fQ9DCQ7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms