Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trmt112Q9DCG9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms