Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms