Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cpne8Q9DC53 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne8Q9DC53 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms