Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde1Q9DBZ9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms