Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Rnf6Q9DBU5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Rnf6Q9DBU5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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