Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg9Q9DB90 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms