Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fundc1Q9DB70 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms