Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift43Q9DA69 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms