Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA17

Tsga13, Testis-specific gene 13 protein, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsga13Q9DA17 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsga13Q9DA17 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsga13Q9DA17 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms