Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms