Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot8Q9D8X5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms