Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms