Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tmem54Q9D7S1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tmem54Q9D7S1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tmem54Q9D7S1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tmem54Q9D7S1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tmem54Q9D7S1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tmem54Q9D7S1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tmem54Q9D7S1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tmem54Q9D7S1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tmem54Q9D7S1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Tmem54Q9D7S1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Tmem54Q9D7S1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Tmem54Q9D7S1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Tmem54Q9D7S1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Tmem54Q9D7S1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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