Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmigd1Q9D7L8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms