Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I9

Tgm5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm5Q9D7I9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tgm5Q9D7I9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgm5Q9D7I9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgm5Q9D7I9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgm5Q9D7I9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms