Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D7E4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms