Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nop56Q9D6Z1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms