Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms