Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6N1

Ca13, Carbonic anhydrase 13, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca13Q9D6N1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ca13Q9D6N1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ca13Q9D6N1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ca13Q9D6N1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ca13Q9D6N1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ca13Q9D6N1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ca13Q9D6N1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ca13Q9D6N1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ca13Q9D6N1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ca13Q9D6N1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ca13Q9D6N1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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